多数植物的种子成熟后，在适宜的条件下会发芽，而有些植物的种子却不能发芽，会休眠，这是由多种原因引起的。首先是种皮的限制。一些植物的种皮不能透水，种子吸收不到水，就不能发芽，如紫云英;另一些植物的种皮不透气，也不能发芽，如椴树;还有一些植物的种皮太坚硬，虽能透水透气，但胚根不能突破种皮，也很难发芽。其次是由于胚发育不完全，如银杏的种子。另外，一些植物的果实里含有抑制种子发芽的物质，如高浓度的脱落酸。
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白鲢鱼